Project
SNOP naar SNIP
De ontwikkeling van een workflow op bijna routinematig niveau om vanuit klinisch materiaal genoomanalyses uit te voeren op moeilijk te kweken bacteriën.
Dit project heeft als doel om vanuit klinisch monstermateriaal genoomanalyses te kunnen uitvoeren op aangifteplichtige intracellulaire bacteriën zoals Chlamydia. De behoefte aan deze analyses neemt toe in het kader van bijvoorbeeld bronopsporing. Echter, voor het genereren van voldoende DNA voor deze analyses is kweek vaak een essentiële tussenstap. Dat is precies het knelpunt voor intracellulaire bacteriën. Die zijn of heel moeilijk te kweken of groeien heel langzaam. In dit project wordt daarom een workflow ontwikkeld waarbij klinisch materiaal het uitgangspunt is. De stip aan de horizon is de implementatie van routinematig sequensen voor bacteriën, zoals al wordt toegepast voor virale ziekteverwekkers zoals vogelgriep en COVID-19.