Project
Kennisbasis landbouwhuisdieren en aquatische soorten
Ontwikkeling en toepassing van nieuwe methoden en inzichten is nodig om de WOT taken effectief en efficiënt te kunnen blijven uitvoeren, en in het bijzonder de kostenefficiëntie en effectiviteit van collectieopbouw en -beheer te verhogen en populatiemanagement te optimaliseren.
In dit project wordt strategische expertise ontwikkeld op een aantal deelterreinen.
Methode-ontwikkeling voor de monitoring van genetische diversiteit en voor populatiemanagement, op basis van genomische data.
Vergroten van inzicht in de genetische diversiteit tussen en binnen rassen (in genenbankcollecties en in situ populaties), op basis van genetische en fenotypische karakterisering
Ontwikkeling van kennis en protocollen op het terrein van reproductie en cryoconservering voor verschillende diersoorten (landbouwhuisdieren en aquatische soorten) en typen genetisch materiaal (sperma, embryo’s, eicellen, ovariumweefsel, primordiale stamcellen).
De KB-WOT voor genetische bronnen van landbouwhuisdierrassen en aquatisch soorten heeft als doel om verbeterde of nieuwe methoden te ontwikkelen, gericht op kostenefficiëntie en effectiviteit van collectieopbouw en collectiebeheer, en voor optimalisatie van populatiemanagement.
Genomica onderzoek wordt ingezet voor de ontwikkeling van methoden voor monitoring van genetische diversiteit en populatiemanagement. Naast genetische karakterisering van populaties en genenbankcollecties wordt tevens kennis gegenereerd over fenotypische verschillen en eigenschappen van rassen, in de context van uiteenlopende productiesystemen.
Daarnaast wordt kennis ontwikkeld op het terrein van reproductie en cryoconservering voor verschillende diersoorten (landbouwhuisdieren en aquatische soorten) en typen genetisch materiaal (sperma, embryo’s, eicellen, ovariumweefsel, primordiale stamcellen).
Publicaties
-
Differences in milk fat composition predicted by mid-infrared spectrometry among dairy cattle breeds in the Netherlands
Journal of Dairy Science (2013), Volume: 96, Issue: 4 - ISSN 0022-0302 - p. 2570-2582. -
Selection of SNP from 50K and 777K arrays to predict breed of origin in cattle
Journal of Animal Science (2013), Volume: 91, Issue: 11 - ISSN 0021-8812 - p. 5128-5134. -
The use of whole genome sequence data to estimate genetic relationships including rare alleles information
In: Proceedings, 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production - p. 47-47. -
Heritability of milk fat composition is considerably lower for Meuse-Rhine-Yssel compared to Holstein Friesian cattle
Livestock Science (2015), Volume: 180 - ISSN 1871-1413 - p. 58-64. -
Supporting genetic management of live populations with gene bank material in a cattle populations
In: Book of Abstracts of the 66th Annual Meeting of the EAAP - Wageningen: Wageningen Academic Publishers - ISBN: 9789086862696 - p. 100-100. -
Overlap in genomic variation associated with milk fat composition in Holstein Friesian and Dutch native dual-purpose breeds
Journal of Dairy Science (2015), Volume: 98, Issue: 9 - ISSN 0022-0302 - p. 6510-6521. -
Whole-genome sequence data uncover loss of genetic diversity due to selection
Genetics, Selection, Evolution (2016), Volume: 48, Issue: 1 - ISSN 0999-193X -
Which individuals to phenotape? Optimal design of reference population for genomic selection while maintaining genetic diversity
-
Conservation priorities for the different lines of Dutch Red and White Friesian cattle change when relationships with other breeds are taken into account
Journal of Animal Breeding and Genetics (2017), Volume: 134, Issue: 1 - ISSN 0931-2668 - p. 69-77. -
Utility of whole genome sequence data for across breed genomic prediction