prof.dr.ir. GC (Gerco) Angenent

prof.dr.ir. GC (Gerco) Angenent

Groepshoofd Plant Developmental Systems (PDS), Hoogleraar
Contact

Wij bestuderen de moleculair genetische regulatie van ontwikkelingsprocessen en proberen de onderliggende netwerken van genen te ontrafelen. Daarbij is een focus op transcriptiefactoren en chromatine modelerende factoren en hoe deze eiwitten moleculair functioneren. De processen die wij bestuderen zijn: bloeiregulatie, bloemorgaanvorming en groei, vruchtontwikkeling, embryogenese en zaadkwaliteit. We maken gebruik van modelplanten zoals Arabidopsis en tomaat en vertalen onze kennis naar gewassen.

Een belangrijke onderzoeksvraag die wij stellen is: Hoe werken Transcriptiefactoren en welke genen controleren ze?  Om deze vraag te beantwoorden bestuderen wij de functie en werking van transcriptiefactoren die behoren tot een van de drie families: de MADS domein, AP2- en TCP families. Deze eiwitten vormen grotere complexen met andere eiwitten en deze interactiepartners identificeren we m.b.v. immunoprecipitatie gevolgd door massa spectrometrie. De transcriptiefactoren binden aan DNA op specifieke plaatsen in het genoom. Wij zijn geinteresseerd in de binding aan het DNA en hoe specificiteit wordt verkregen. Dit bestuderen we met methoden zoals ChIP-seq, DAP-seq, RNA-seq en EMSA. Deze experimenten laat zien dat de samenstelling van het transcriptiefactorcomplex bijdraagt aan de specificiteit van DNA binding en daarmee de regulatie van genen. Voor een aantal ontwikkelingsprocessen, zoals bloeiregulatie, bloemvorming, embryogenese en vruchtontwikkeling, proberen we de genen die gereguleerd worden door de bovengenoemde transcriptiefactoren te identificeren. Deze zgn. targetgenen kunnen een deel van de functies van de transcriptiefactoren verzorgen.

 

========================================================================

De verantwoordelijke onderzoekers in de groep zijn:

De Plant Developmental Systems group

Medewerkers groep (van links naar rechts):

  • prof. dr. Gerco Angenent,  groepshoofd
  • dr. Kim Boutilier, senior onderzoeker
  • dr. Ruud de Maagd, senior onderzoeker
  • prof. dr. Richard Immink, senior onderzoeker
  • dr. Marian Bemer, Universitair docent (Leerstoel Biosystematics)
  • dr. Martijn Fiers, onderzoeker
  • dr. Xinping Yang, postdoc
  • dr. Dawit Tekleyohans, postdoc
  • dr. Cristian Pena-Ponton, postdoc
  • Marco Busscher, analist
  • Jan Kodde, analist
  • Tjitske Riksen, analist
  • Mieke Weemen, analist
  • Froukje van der Wal, analist
  • Jacqueline Busscher-Lange, analist
  • Michiel Lammers, analist
  • Chris Roelofsen, analist
  • Suze Blom, PhD student (bij Richard Immink)
  • Judit Nadal, PhD student (bij Richard Immink)
  • Iris Zahn, PhD student (bij Marian Bemer)
  • Gül Hatinoglu, PhD student (bij Ruud de Maagd en Richard Immink) 
  • Kai Thoris, PhD student (bij Marian Bemer)
  • Victor Aprilyanto, PhD student (bij Ruud de Maagd)
  • Mengran Li, PhD student (bij Kim Boutilier)
  • Xiaowei Wang, PhD student (bij Ruud de Maagd)
  • Kailash Pandey, PhD student (Bij Marian Bemer)
  • Qiqi Li, PhD student (bij Richard Immink)
  • Indira Bretones, PhD student (bij Marian Bemer)
  • Chris Darmawan, PhD student (bij Kim Boutilier)
  • Isabella Sanders, PhD student (bij Richard Immink en Marian Bemer)
  • Lotte Zuurveen, PhD student (bij Ruud de Maagd)

---------------------------------------------------------------------------------------------

De volgende promovendi zijn recentelijk gepromoveerd op onderzoek van onze groep: 

Promotie Ellen Slaman, 30 augustus 2023, Wageningen Universiteit

CRISPR specificity in tomato

Promotie Charlotte Siemons, 26 oktober 2022. Wageningen universiteit. 

From microspore to haploid embryo. 

Promotie Annemarie Castricum 19 oktober 2022, Wageningen Universiteit

Elucidation of the morphological and genetic factors influencing fertility in Chrysanthemum

Promotie Lena Maas September 9, 2022. Wageningen Universiteit

Regulation of morphogenic genes, exploring the function and cis-regulatory landscape of BABYBOOM and LEAFY COTELEDON1