Genome in equilibrium: Subgenome expression bias in allotetraploid common carp

Samenvatting

Het doel van dit proefschrift was om bij te dragen aan de fundamentele kennis van dieren die een gedupliceerde genoom hebben (polyploïde), door de europese karper als diermodel te gebruiken. Dit proefschrift richtte zich op de vraag of beide subgenomen in karper behouden zijn gebleven door functies te delen tussen subgenoom A en B, of door functionele specialisatie van een van beide subgenomen.

Mijn onderzoek toont het belang aan van het bestuderen van beide subgenomen en hun gedupliceerde genen om de biologische functie en gen evolutie in een polyploïde dier volledig te begrijpen. Ik toon aan dat er geen duidelijke subgenoomdominantie is van één subgenoom in karper. Subgenoom A en B behouden hun gedupliceerde genen door middel van gebalanceerde expressie, waarbij de meeste co-expressie vertonen met of zonder subgenoombias.