Sulfotyrosine-Containing Plant Peptide Hormones: Synthetic Approaches and Nanopore Sequencing of Post-Translationally Modified Peptides

Samenvatting

Post-Translationele Modificaties (PTMs) zijn essentieel voor eiwit structuur en functie. Terwijl fosforylering (PO3H2) een veelvoorkomende PTM op natuurlijke eiwitten is die intracellulaire signalering reguleert, wordt sulfering (SO3H) beschouwd als zeer belangrijke modificatie voor plantengroei en -ontwikkeling. Plant Peptide Hormonen (PPHs) zijn natuurlijke regulerende moleculen, die bioactief zijn in nanomolaire concentratie. Drie PTMs zijn gevonden in PPHs, namelijk: sulfotyrosine, hydroxyproline, en gearabinosyleerde hydroxyproline. Ondanks dat deze modificaties in de cel op enzymatisch niveau plaatsvinden, blijft de chemische synthese van sulfotyrosine-bevattende peptiden lastig dankzij de zuur-labiele karakter van een sulfaat-groep. Bovendien is het identificeren of analyseren van sulfo-bevattende peptiden of eiwitten een uitdaging met behulp van standaard massa spectrometrie methoden.
In dit proefschrift wordt de chemische synthese van twee types sulfotyrosine-bevattende PPHs beschreven, gevolgd door evaluatie van biologische activiteit in protoplast proliferatie experimenten. Daarnaast worden PTM identificatie en peptide analyse met behulp van nanopore sequencing bestudeerd en ontwikkeld om betere eiwitanalyse te bereiken.