Dynamic genome organization in an arbuscular mycorrhizal fungus

Samenvatting

Arbusculaire mycorrhiza schimmels zijn veel voorkomende planten symbioten. Ze ondersteunen de ontwikkeling van de plant waarop ze groeien. Ze kunnen een interactie aangaan met de meeste soorten landplanten, waaronder belangrijke gewassen zoals rijst, maïs, graan en aardappel. Hun hele mycelium bestaat uit een enkele cel, met miljoenen celkernen. Isolaten van de schimmel Rhizophagus irregularis variëren in hoe verschillend hun kernen van elkaar zijn, maar de rol van deze kerntypes in de symbiose is nog onduidelijk. In deze thesis analyseerde ik het totale genoom van isolaat C3, en dat van individuele kernen, om aan te tonen dat de kern compositie in deze schimmel varieert tussen sporen, en dat de twee voornaamste kerntypes met elkaar kunnen recombineren. Daarnaast laat ik zien dat mycorrhiza isolaten verschillen in hoeveel ze de groei van bepaalde plantensoorten bevorderen, en welke genen ze daarvoor uitdrukken.